Sélection assistée par marqueurs

Actualisation de la population de référence

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 de la Préfecture de région Franche-Comté

Le Fond Européen de Développement Régional a soutenu une action proposée par la race Montbéliarde : l’actualisation de la population de référence.

Elle a été réalisée cet hiver et aura une application pratique dès ce mois de juin. Elle est utile pour tous les index SAM calculés. Que ce soit pour des animaux des schémas de sélection, ou pour des vaches ou génisses que des éleveurs souhaiteraient prochainement sélectionner chez eux avec la SAM. Ce service sera ouvert début 2011 aux éleveurs.

Sans rentrer dans le détail biologique, la sélection assistée par marqueurs peut se résumer ainsi (cf. illustration) :

• A partir d’un groupe de taureaux évalués sur descendance, génotypés avec la puce de 54.000 marqueurs, l’INRA établie des équations de prédiction de l’index des animaux caractère par caractère. Ce groupe est appelé « Population de référence ».
• Ensuite ces équations de prédictions sont appliquées à de simple génotypages de veaux ou de vaches pour prédire leur index.

La précision de l’index obtenu dépend de la fiabilité des équations de prédiction. Et cette fiabilité dépend un de la taille de la population de référence et deux de sa représentation c'est-à-dire de la représentation des différentes souches de la race, de taureaux aux générations récentes et de taureaux aux parents typés pour déterminer les « phases ».

L’action soutenue par le FEDER de Franche-Comté, France Agrimer et le conseil régional de Franche-Comté a consisté à participer au financement de typage de taureaux déjà indexés. Sans utilité directe pour les entreprises de sélection ils sont utiles pour élargir la gamme des taureaux présents dans la population de référence (taureaux en S, T ou U sortis indexés avant les premières estimations SAM) ou sont simplement ascendants de taureaux présents dans la population (Tartars, Boulogne, Belindex, Embrun, Espada, Faucon, Gel, Goncourt). Ainsi 856 taureaux ont été analysés cet hiver de décembre à avril.

La population de référence de la race va donc passer de 804 taureaux Montbéliards en juin 2009 à 1500 environ ce mois ci.

Simultanément à cette action l’INRA va compléter la liste des caractères indexés par Sélection Assistée par Marqueurs. Ainsi la longévité va faire son apparition aux coté des caractères de facilité de naissance et de vêlage et de vitalité à la naissance et au vêlage. Tous les caractères de morphologie seront aussi concernés. Pour la Montbéliarde ce seront 10 caractères de morphologie nouveaux publiés y compris le tempérament.

Le gain de fiabilité se traduira en partie par quelques points de CD (coefficient de détermination) en plus des index SAM et donc une meilleure précision. Mais il faut rappeler ici que pour les caractères de production leur précision reste inférieure au testage sur descendance et donc que l’utilisation des taureaux doit rester soit parcimonieuse dans le troupeau si elle concerne que un seul taureau ou doit rester fonder sur une utilisation d’un nombre très large de taureaux génomique proposés pour limiter les risques. Cette dernière option a l’avantage d’apporter en plus de la diversité dans son troupeau et dans la race.